Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1EQ9GZS1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms