Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCLK3Q9C098 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms