Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM9Q9C026 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM9Q9C026 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms