Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRA6Q9BX79 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRA6Q9BX79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms