Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
THUMPD2Q9BTF0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
THUMPD2Q9BTF0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
THUMPD2Q9BTF0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
THUMPD2Q9BTF0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
THUMPD2Q9BTF0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
THUMPD2Q9BTF0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
THUMPD2Q9BTF0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms