Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBM42Q9BTD8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RBM42Q9BTD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RBM42Q9BTD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms