Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2D3AQ9BRG2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms