Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN18Q96SJ8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms