Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERGIC2Q96RQ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms