Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNGAP1Q96PV0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNGAP1Q96PV0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms