Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP295NLQ96MC4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP295NLQ96MC4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP295NLQ96MC4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP295NLQ96MC4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP295NLQ96MC4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP295NLQ96MC4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms