Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRC1Q96M27 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRC1Q96M27 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms