Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEURL4Q96JN8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEURL4Q96JN8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms