Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL26A1Q96A83 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL26A1Q96A83 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms