Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJA4Q8WW22 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms