Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCZ7

LINC00308, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00308, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00308Q8TCZ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00308Q8TCZ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00308Q8TCZ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 345.3 ms