Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C2CD4AQ8NCU7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms