Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PNLDC1Q8NA58 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms