Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYD8

FANCM, Fanconi anemia group M protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCMQ8IYD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCMQ8IYD8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCMQ8IYD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCMQ8IYD8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms