Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP27Q6ZUM4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGAP27Q6ZUM4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGAP27Q6ZUM4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGAP27Q6ZUM4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGAP27Q6ZUM4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGAP27Q6ZUM4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGAP27Q6ZUM4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGAP27Q6ZUM4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGAP27Q6ZUM4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms