Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBRD2Q68DH5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBRD2Q68DH5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD2Q68DH5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms