Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms