Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CROCCQ5TZA2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROCCQ5TZA2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms