Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C4orf17Q53FE4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms