Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9B1Q4ZJI4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms