Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KHDC1Q4VXA5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms