Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTDC1Q4AE62 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTDC1Q4AE62 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms