Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
FHOD3Q2V2M9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FHOD3Q2V2M9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FHOD3Q2V2M9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
FHOD3Q2V2M9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms