Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZIC1Q15915 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms