Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NKX1-1Q15270 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NKX1-1Q15270 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
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