Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDC1Q14676 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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