Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN4PQ13434 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MKRN4PQ13434 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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