Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKP2Q13309 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKP2Q13309 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SKP2Q13309 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKP2Q13309 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP2Q13309 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP2Q13309 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP2Q13309 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP2Q13309 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKP2Q13309 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKP2Q13309 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP2Q13309 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKP2Q13309 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKP2Q13309 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP2Q13309 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP2Q13309 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKP2Q13309 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKP2Q13309 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SKP2Q13309 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP2Q13309 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP2Q13309 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKP2Q13309 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKP2Q13309 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP2Q13309 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP2Q13309 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKP2Q13309 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKP2Q13309 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SKP2Q13309 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP2Q13309 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP2Q13309 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKP2Q13309 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKP2Q13309 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKP2Q13309 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKP2Q13309 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKP2Q13309 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKP2Q13309 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKP2Q13309 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKP2Q13309 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKP2Q13309 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKP2Q13309 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKP2Q13309 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKP2Q13309 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKP2Q13309 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKP2Q13309 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKP2Q13309 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKP2Q13309 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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