Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 XRCC5-205ENST00000451695 415 ntTSL 52.82□□□□□ -1.965e-7■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 UGDH-207ENST00000509391 577 ntTSL 320■□□□□ 0.792e-15■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 UGDH-203ENST00000503779 575 ntTSL 420■□□□□ 0.792e-15■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 UGDH-209ENST00000510881 549 ntTSL 36.38□□□□□ -1.392e-15■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-9■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 EIF3D-208ENST00000458572 883 ntTSL 310.65□□□□□ -0.77e-7■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 GDI2-207ENST00000479928 2499 ntTSL 210.92□□□□□ -0.669e-8■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 CCAR2-209ENST00000521436 1840 ntTSL 518.86■□□□□ 0.614e-6■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.124e-7■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 ADH5-203ENST00000502590 697 ntTSL 511.93□□□□□ -0.57e-8■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 QARS-212ENST00000470225 691 ntTSL 516.56■□□□□ 0.241e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 ACACA-245ENST00000619546 5315 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.45e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.065e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 ATXN10-204ENST00000435026 653 ntTSL 312.6□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 ATXN10-209ENST00000483549 778 ntTSL 29.75□□□□□ -0.855e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PSMA4-216ENST00000559948 710 ntTSL 510.86□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PSMA4-213ENST00000559437 756 ntTSL 510.1□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PSMA4-210ENST00000559146 674 ntTSL 29.72□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PSMA4-211ENST00000559154 637 ntTSL 25.7□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 DIAPH1-213ENST00000523100 1180 ntTSL 529.56■■■□□ 2.324e-8■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PPP2R5D-201ENST00000230402 2958 ntTSL 216■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PPP2R5D-205ENST00000470467 2567 ntTSL 1 (best)15.74■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PPP2R5D-203ENST00000461010 1558 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 LRPPRC-207ENST00000467058 557 ntTSL 37.05□□□□□ -1.288e-10■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 HNRNPM-211ENST00000598603 784 ntTSL 222.69■■□□□ 1.222e-6■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 21e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.371e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.371e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.341e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 MLF2-209ENST00000541346 1234 ntTSL 520.97■□□□□ 0.951e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 MLF2-205ENST00000537126 851 ntTSL 520.87■□□□□ 0.931e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 ADD1-225ENST00000539149 460 ntTSL 218.63■□□□□ 0.576e-7■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PARP1-204ENST00000463968 830 ntTSL 213.45□□□□□ -0.262e-10■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 MCM5-206ENST00000451351 450 ntTSL 412.83□□□□□ -0.362e-10■■■■□ 19.8
G3BP1Q13283 PKM-224ENST00000569857 1355 ntTSL 515.4■□□□□ 0.061e-17■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 SHMT2-208ENST00000553868 941 ntTSL 217.76■□□□□ 0.435e-8■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 SHMT2-218ENST00000555213 611 ntTSL 313.48□□□□□ -0.255e-8■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 OGFOD1-207ENST00000566157 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 OGFOD1-201ENST00000336111 2415 ntTSL 210.92□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 511.11□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 ANXA5-206ENST00000511552 1036 ntTSL 327.65■■■□□ 2.023e-7■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 SEC16A-207ENST00000453963 4834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.51□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 VPS35-210ENST00000568784 4017 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.369e-7■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.239e-7■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 SPTAN1-210ENST00000625282 4102 ntTSL 210.21□□□□□ -0.785e-8■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 COQ8A-209ENST00000489044 941 ntTSL 322.98■■□□□ 1.278e-7■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 GART-208ENST00000430874 1036 ntTSL 525.79■■□□□ 1.724e-8■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.688e-10■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 GART-214ENST00000476524 806 ntTSL 211.09□□□□□ -0.634e-8■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 STARD7-203ENST00000462501 753 ntTSL 210.83□□□□□ -0.688e-10■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 GART-202ENST00000366093 805 ntTSL 310.16□□□□□ -0.784e-8■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 GART-207ENST00000426819 837 ntTSL 59.69□□□□□ -0.864e-8■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 GART-218ENST00000497313 457 ntTSL 39.56□□□□□ -0.884e-8■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.968e-7■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 GART-217ENST00000488791 778 ntTSL 38.38□□□□□ -1.074e-8■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 STARD7-204ENST00000479456 2949 ntTSL 27.66□□□□□ -1.188e-10■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 PRMT5-227ENST00000557758 597 ntTSL 36.61□□□□□ -1.358e-10■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 SPTAN1-216ENST00000629047 401 ntTSL 22.31□□□□□ -2.048e-10■■■■□ 19.7
G3BP1Q13283 NUP188-205ENST00000477069 2941 ntTSL 1 (best)13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 MED1-203ENST00000577831 4584 ntTSL 211.27□□□□□ -0.615e-6■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.775e-6■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.095e-6■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 PGK1-202ENST00000474281 307 ntTSL 1 (best)4.98□□□□□ -1.615e-23■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 311.8□□□□□ -0.522e-8■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.759e-7■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.649e-7■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 518.79■□□□□ 0.69e-7■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.364e-7■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 DARS-203ENST00000435076 717 ntTSL 214.68□□□□□ -0.063e-7■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 COQ8A-206ENST00000479852 1938 ntTSL 1 (best)26.48■■□□□ 1.834e-7■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 523.63■■□□□ 1.378e-7■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 223.02■■□□□ 1.288e-7■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 LDHA-213ENST00000535451 465 ntTSL 415.04■□□□□ -06e-33■■■■□ 19.6
G3BP1Q13283 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.391e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 HSD17B4-203ENST00000442060 2686 ntTSL 516.86■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 HSD17B4-221ENST00000515235 5540 ntTSL 211.16□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.161e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.823e-7■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 223.49■■□□□ 1.353e-7■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.33e-7■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 57.87□□□□□ -1.153e-7■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 PKM-221ENST00000568743 580 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.46e-21■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 LDHA-211ENST00000494573 1154 ntTSL 213.64□□□□□ -0.236e-33■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 213.55□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 KARS-210ENST00000568682 870 ntTSL 37.6□□□□□ -1.198e-7■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 LDHA-224ENST00000545467 570 ntTSL 29.51□□□□□ -0.894e-33■■■■□ 19.5
G3BP1Q13283 ACSF2-213ENST00000507792 716 ntTSL 218.95■□□□□ 0.627e-14■■■■□ 19.5
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 436.8 ms