RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430874.5

GART-208, Transcript of phosphoribosylglycinamide formyltransferase, phosphoribosylglycinamide synthetase, phosphoribosylaminoimidazole synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene GART, Length 1,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GART-208ENST00000430874 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.64■■■■■ 6.02
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GART-208ENST00000430874 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.12■■■■■ 5.13
GART-208ENST00000430874 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.3■■■■■ 4.84
GART-208ENST00000430874 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.17■■■■■ 4.82
GART-208ENST00000430874 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.94■■■■■ 4.78
GART-208ENST00000430874 NACADO15069 1562 aa44.82■■■■■ 4.76
GART-208ENST00000430874 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.61■■■■■ 4.73
GART-208ENST00000430874 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.08■■■■■ 4.65
GART-208ENST00000430874 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.94■■■■■ 4.62
GART-208ENST00000430874 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.87■■■■■ 4.61
GART-208ENST00000430874 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
GART-208ENST00000430874 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.39■■■■■ 4.54
GART-208ENST00000430874 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.19■■■■■ 4.5
GART-208ENST00000430874 SCRIBQ14160 1630 aa43.06■■■■■ 4.48
GART-208ENST00000430874 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.05■■■■■ 4.48
GART-208ENST00000430874 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43■■■■■ 4.47
GART-208ENST00000430874 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
GART-208ENST00000430874 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.82■■■■■ 4.29
GART-208ENST00000430874 NCAPD3P42695 1498 aa41.49■■■■■ 4.23
GART-208ENST00000430874 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.3■■■■■ 4.2
GART-208ENST00000430874 ERCC6Q03468 1493 aa41.24■■■■■ 4.19
GART-208ENST00000430874 CUX2O14529 1486 aa41.21■■■■■ 4.19
GART-208ENST00000430874 SMARCA2P51531 1590 aa41.07■■■■■ 4.16
GART-208ENST00000430874 SMARCA4P51532 1647 aa41.02■■■■■ 4.16
GART-208ENST00000430874 HMGXB3Q12766 1538 aa40.98■■■■■ 4.15
GART-208ENST00000430874 NESP48681 1621 aa40.92■■■■■ 4.14
GART-208ENST00000430874 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
GART-208ENST00000430874 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
GART-208ENST00000430874 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.62■■■■■ 4.09
GART-208ENST00000430874 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.57■■■■■ 4.08
GART-208ENST00000430874 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.46■■■■■ 4.07
GART-208ENST00000430874 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.41■■■■■ 4.06
GART-208ENST00000430874 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
GART-208ENST00000430874 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.27■■■■■ 4.04
GART-208ENST00000430874 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.15■■■■■ 4.02
GART-208ENST00000430874 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.98■■■■□ 3.99
GART-208ENST00000430874 WIZO95785 1651 aa39.98■■■■□ 3.99
GART-208ENST00000430874 TRIM41Q8WV44 630 aa39.86■■■■□ 3.97
GART-208ENST00000430874 WDR62O43379 1518 aa39.81■■■■□ 3.96
GART-208ENST00000430874 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.75■■■■□ 3.95
GART-208ENST00000430874 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.73■■■■□ 3.95
GART-208ENST00000430874 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
GART-208ENST00000430874 CFTRP13569 1480 aa39.66■■■■□ 3.94
GART-208ENST00000430874 OSCARQ8IYS5 282 aa39.55■■■■□ 3.92
GART-208ENST00000430874 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
GART-208ENST00000430874 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
GART-208ENST00000430874 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.16■■■■□ 3.86
GART-208ENST00000430874 IFT140Q96RY7 1462 aa39.01■■■■□ 3.84
GART-208ENST00000430874 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
GART-208ENST00000430874 TOPBP1Q92547 1522 aa38.91■■■■□ 3.82
GART-208ENST00000430874 PRDM2Q13029 1718 aa38.86■■■■□ 3.81
GART-208ENST00000430874 ABCC8Q09428 1581 aa38.83■■■■□ 3.81
GART-208ENST00000430874 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.74■■■■□ 3.79
GART-208ENST00000430874 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.74■■■■□ 3.79
GART-208ENST00000430874 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.74■■■■□ 3.79
GART-208ENST00000430874 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.68■■■■□ 3.781e-7■■■■□ 21.1
GART-208ENST00000430874 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.68■■■■□ 3.78
GART-208ENST00000430874 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.65■■■■□ 3.78
GART-208ENST00000430874 ARHGEF11O15085 1522 aa38.65■■■■□ 3.78
GART-208ENST00000430874 FBLN2P98095 1184 aa38.64■■■■□ 3.78
GART-208ENST00000430874 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
GART-208ENST00000430874 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
GART-208ENST00000430874 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
GART-208ENST00000430874 SOGA1O94964 1423 aa38.45■■■■□ 3.75
GART-208ENST00000430874 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
GART-208ENST00000430874 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.44■■■■□ 3.74
GART-208ENST00000430874 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
GART-208ENST00000430874 CHD1O14646 1710 aa38.3■■■■□ 3.72
GART-208ENST00000430874 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
GART-208ENST00000430874 ARAP1Q96P48 1450 aa38.26■■■■□ 3.72
GART-208ENST00000430874 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.21■■■■□ 3.71
GART-208ENST00000430874 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.16■■■■□ 3.7
GART-208ENST00000430874 CUX1P39880 1505 aa38.1■■■■□ 3.69
GART-208ENST00000430874 GRIN2BQ13224 1484 aa38.05■■■■□ 3.68
GART-208ENST00000430874 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
GART-208ENST00000430874 WDR97A6NE52 1622 aa38.01■■■■□ 3.67
GART-208ENST00000430874 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.97■■■■□ 3.67
GART-208ENST00000430874 SYNJ2O15056 1496 aa37.94■■■■□ 3.66
GART-208ENST00000430874 SYNJ1O43426 1573 aa37.93■■■■□ 3.66
GART-208ENST00000430874 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
GART-208ENST00000430874 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.89■■■■□ 3.66
GART-208ENST00000430874 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.76■■■■□ 3.63
GART-208ENST00000430874 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.63■■■■□ 3.61
GART-208ENST00000430874 PBRM1Q86U86 1689 aa37.62■■■■□ 3.61
GART-208ENST00000430874 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.58■■■■□ 3.61
GART-208ENST00000430874 GRIN2AQ12879 1464 aa37.52■■■■□ 3.6
GART-208ENST00000430874 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
GART-208ENST00000430874 NUP160Q12769 1436 aa37.43■■■■□ 3.58
GART-208ENST00000430874 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.42■■■■□ 3.58
GART-208ENST00000430874 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.41■■■■□ 3.58
GART-208ENST00000430874 TOP2BQ02880 1626 aa37.34■■■■□ 3.57
GART-208ENST00000430874 CEP170Q5SW79 1584 aa37.34■■■■□ 3.57
GART-208ENST00000430874 ADAMTS12P58397 1594 aa37.33■■■■□ 3.57
GART-208ENST00000430874 JPH4Q96JJ6 628 aa37.28■■■■□ 3.56
GART-208ENST00000430874 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.26■■■■□ 3.56
GART-208ENST00000430874 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.24■■■■□ 3.55
GART-208ENST00000430874 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
GART-208ENST00000430874 SHROOM2Q13796 1616 aa37.15■■■■□ 3.54
GART-208ENST00000430874 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.02■■■■□ 3.52
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