Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIGQ13278 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIGQ13278 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIGQ13278 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIGQ13278 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIGQ13278 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIGQ13278 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIGQ13278 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIGQ13278 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIGQ13278 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIGQ13278 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIGQ13278 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIGQ13278 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIGQ13278 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIGQ13278 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIGQ13278 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIGQ13278 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIGQ13278 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIGQ13278 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIGQ13278 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIGQ13278 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIGQ13278 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIGQ13278 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIGQ13278 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIGQ13278 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIGQ13278 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIGQ13278 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIGQ13278 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIGQ13278 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIGQ13278 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIGQ13278 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIGQ13278 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIGQ13278 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIGQ13278 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIGQ13278 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIGQ13278 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIGQ13278 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIGQ13278 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIGQ13278 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIGQ13278 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIGQ13278 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIGQ13278 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIGQ13278 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIGQ13278 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIGQ13278 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIGQ13278 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIGQ13278 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIGQ13278 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIGQ13278 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIGQ13278 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIGQ13278 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIGQ13278 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIGQ13278 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIGQ13278 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIGQ13278 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIGQ13278 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIGQ13278 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIGQ13278 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIGQ13278 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIGQ13278 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIGQ13278 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIGQ13278 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIGQ13278 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIGQ13278 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIGQ13278 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIGQ13278 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIGQ13278 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIGQ13278 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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