Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRDNQ13061 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRDNQ13061 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRDNQ13061 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRDNQ13061 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRDNQ13061 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRDNQ13061 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TRDNQ13061 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRDNQ13061 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRDNQ13061 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRDNQ13061 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRDNQ13061 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRDNQ13061 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRDNQ13061 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRDNQ13061 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRDNQ13061 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRDNQ13061 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRDNQ13061 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRDNQ13061 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRDNQ13061 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TRDNQ13061 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRDNQ13061 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRDNQ13061 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRDNQ13061 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRDNQ13061 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRDNQ13061 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRDNQ13061 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRDNQ13061 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRDNQ13061 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRDNQ13061 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRDNQ13061 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRDNQ13061 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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