Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 TERT-203ENST00000460137 2992 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.532e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 MAD1L1-221ENST00000486340 646 ntTSL 318.14■□□□□ 0.492e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 CDKN1A-207ENST00000478800 616 ntTSL 217.88■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.442e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 STUB1-210ENST00000567790 428 ntTSL 316.56■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TMEM219-208ENST00000575829 721 ntTSL 513.89□□□□□ -0.192e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TMEM219-206ENST00000569481 443 ntTSL 312.71□□□□□ -0.372e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TMEM219-207ENST00000570255 926 ntTSL 212.3□□□□□ -0.442e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TMEM219-205ENST00000569445 760 ntTSL 211.16□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 MAD1L1-214ENST00000459731 371 ntTSL 311□□□□□ -0.652e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.055e-9■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.366e-6■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 CLDN4-203ENST00000435050 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.546e-6■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 CLDN4-202ENST00000431918 4108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.676e-6■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 FRAS1-205ENST00000509802 564 ntTSL 57.96□□□□□ -1.146e-6■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.266e-6■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.386e-6■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.386e-6■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.466e-6■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.496e-6■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)16.32■□□□□ 0.26e-9■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.076e-9■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.286e-9■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.286e-9■■□□□ 12.3
GRSF1Q12849 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.253e-6■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 YKT6-202ENST00000421621 2463 ntTSL 1 (best)15.79■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.471e-42■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.341e-42■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 GPX3-206ENST00000521632 1314 ntTSL 516.36■□□□□ 0.211e-42■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-42■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.872e-10■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 C2orf72-203ENST00000477463 579 ntTSL 412.36□□□□□ -0.432e-10■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.872e-11■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 PHF10-204ENST00000480008 4285 ntTSL 1 (best)16.37■□□□□ 0.212e-11■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-11■■□□□ 12.2
GRSF1Q12849 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.881e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 UGDH-208ENST00000510490 534 ntTSL 420.34■□□□□ 0.851e-11■■□□□ 12.1
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GRSF1Q12849 UGDH-203ENST00000503779 575 ntTSL 417.4■□□□□ 0.381e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 UGDH-207ENST00000509391 577 ntTSL 317.4■□□□□ 0.381e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 UGDH-210ENST00000514106 568 ntTSL 416.81■□□□□ 0.281e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 UGDH-212ENST00000515398 584 ntTSL 516.81■□□□□ 0.281e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-231ENST00000639599 1283 ntTSL 515.81■□□□□ 0.121e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.041e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.171e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.261e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-202ENST00000315091 1835 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-221ENST00000619555 682 ntTSL 511.95□□□□□ -0.51e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-223ENST00000620632 706 ntTSL 311.19□□□□□ -0.621e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-206ENST00000473869 1946 ntTSL 510.76□□□□□ -0.691e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-211ENST00000610369 563 ntTSL 510.32□□□□□ -0.761e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.91e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-222ENST00000620505 657 ntTSL 59.4□□□□□ -0.91e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-224ENST00000621573 992 ntTSL 38.37□□□□□ -1.071e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-219ENST00000617757 434 ntTSL 38.14□□□□□ -1.111e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-213ENST00000611963 739 ntTSL 58.04□□□□□ -1.121e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-216ENST00000614494 515 ntTSL 57.81□□□□□ -1.161e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-210ENST00000496840 692 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 UGDH-209ENST00000510881 549 ntTSL 35.47□□□□□ -1.531e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 UGDH-204ENST00000505698 433 ntTSL 45.29□□□□□ -1.561e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 AL109811.4-204ENST00000622108 645 ntTSL 54.94□□□□□ -1.621e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 AL109811.4-202ENST00000611136 700 ntTSL 54.61□□□□□ -1.671e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-214ENST00000613177 379 ntTSL 34.08□□□□□ -1.761e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-212ENST00000611008 929 ntTSL 53.59□□□□□ -1.831e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 AL109811.4-203ENST00000612542 554 ntAPPRIS P1 TSL 53.33□□□□□ -1.881e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 TARDBP-208ENST00000477447 409 ntTSL 53.33□□□□□ -1.881e-11■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.031e-14■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.369e-7■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 RCC1-211ENST00000478232 509 ntTSL 214.66□□□□□ -0.069e-7■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.079e-7■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.629e-7■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.769e-7■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 FKBP2-205ENST00000536642 637 ntTSL 220.67■□□□□ 0.96e-7■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.896e-7■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 FKBP2-206ENST00000541388 705 ntTSL 520.33■□□□□ 0.856e-7■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.316e-7■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.026e-7■■□□□ 12.1
GRSF1Q12849 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 12
GRSF1Q12849 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.882e-13■■□□□ 12
GRSF1Q12849 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.012e-13■■□□□ 12
GRSF1Q12849 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.58e-13■■□□□ 12
GRSF1Q12849 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.198e-13■■□□□ 12
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