Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A2Q05940 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A2Q05940 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms