Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ERCC6Q03468 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ERCC6Q03468 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ERCC6Q03468 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ERCC6Q03468 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ERCC6Q03468 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms