Protein–RNA interactions for Protein: P98179

RBM3, RNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3P98179 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM3P98179 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM3P98179 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM3P98179 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBM3P98179 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBM3P98179 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBM3P98179 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBM3P98179 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBM3P98179 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBM3P98179 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBM3P98179 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBM3P98179 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBM3P98179 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RBM3P98179 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBM3P98179 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBM3P98179 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBM3P98179 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBM3P98179 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBM3P98179 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBM3P98179 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBM3P98179 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM3P98179 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM3P98179 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM3P98179 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM3P98179 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM3P98179 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM3P98179 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM3P98179 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM3P98179 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBM3P98179 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBM3P98179 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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