Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRPS35P82673 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPS35P82673 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms