Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2IP78347 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2IP78347 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms