Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS13P62277 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS13P62277 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS13P62277 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS13P62277 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS13P62277 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS13P62277 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS13P62277 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS13P62277 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS13P62277 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS13P62277 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS13P62277 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS13P62277 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS13P62277 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS13P62277 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS13P62277 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS13P62277 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS13P62277 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS13P62277 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS13P62277 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS13P62277 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS13P62277 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS13P62277 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS13P62277 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS13P62277 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS13P62277 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS13P62277 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS13P62277 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS13P62277 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS13P62277 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS13P62277 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS13P62277 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS13P62277 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS13P62277 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS13P62277 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS13P62277 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS13P62277 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS13P62277 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS13P62277 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS13P62277 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS13P62277 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS13P62277 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS13P62277 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS13P62277 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS13P62277 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS13P62277 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS13P62277 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS13P62277 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS13P62277 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS13P62277 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS13P62277 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS13P62277 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS13P62277 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS13P62277 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS13P62277 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS13P62277 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS13P62277 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS13P62277 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS13P62277 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS13P62277 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS13P62277 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS13P62277 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS13P62277 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS13P62277 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS13P62277 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS13P62277 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS13P62277 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS13P62277 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS13P62277 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS13P62277 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS13P62277 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS13P62277 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS13P62277 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS13P62277 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms