Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ1P61923 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ1P61923 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms