Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB10P61026 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB10P61026 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB10P61026 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB10P61026 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB10P61026 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB10P61026 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB10P61026 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB10P61026 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB10P61026 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB10P61026 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB10P61026 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB10P61026 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB10P61026 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB10P61026 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB10P61026 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB10P61026 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB10P61026 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB10P61026 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB10P61026 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB10P61026 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB10P61026 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB10P61026 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB10P61026 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB10P61026 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB10P61026 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB10P61026 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB10P61026 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB10P61026 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB10P61026 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB10P61026 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB10P61026 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB10P61026 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB10P61026 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB10P61026 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB10P61026 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB10P61026 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB10P61026 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB10P61026 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB10P61026 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB10P61026 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB10P61026 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB10P61026 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB10P61026 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB10P61026 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB10P61026 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB10P61026 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB10P61026 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB10P61026 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB10P61026 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB10P61026 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB10P61026 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB10P61026 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB10P61026 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB10P61026 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB10P61026 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB10P61026 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB10P61026 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB10P61026 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB10P61026 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB10P61026 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB10P61026 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB10P61026 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB10P61026 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB10P61026 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB10P61026 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB10P61026 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB10P61026 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms