Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB15P59190 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB15P59190 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB15P59190 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB15P59190 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB15P59190 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB15P59190 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB15P59190 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB15P59190 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB15P59190 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB15P59190 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB15P59190 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB15P59190 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB15P59190 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB15P59190 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB15P59190 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB15P59190 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB15P59190 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB15P59190 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB15P59190 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB15P59190 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB15P59190 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB15P59190 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB15P59190 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB15P59190 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB15P59190 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB15P59190 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB15P59190 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB15P59190 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB15P59190 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB15P59190 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB15P59190 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB15P59190 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB15P59190 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB15P59190 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB15P59190 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB15P59190 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB15P59190 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB15P59190 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB15P59190 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB15P59190 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB15P59190 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB15P59190 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB15P59190 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB15P59190 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB15P59190 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB15P59190 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB15P59190 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB15P59190 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB15P59190 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB15P59190 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB15P59190 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB15P59190 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB15P59190 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB15P59190 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB15P59190 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB15P59190 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB15P59190 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB15P59190 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB15P59190 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB15P59190 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB15P59190 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB15P59190 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB15P59190 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB15P59190 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB15P59190 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB15P59190 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB15P59190 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB15P59190 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB15P59190 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB15P59190 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms