Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP4P57723 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms