Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRP55822 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BGRP55822 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms