Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSE1LP55060 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms